脏象学说就是人体的脏腑学说，它不是单纯的指是一个解剖学的概念，重要的是一个生理、病理学方面的概念，古人认为：藏象有两种含义，一是指人体之脏，二是指比类取象；这里象是包括脏腑外部显露出来的，直接可见的具体形象，又包括脏腑内部蕴含的征象，也就是生理、病理之象，所谓比类取象，就是用类比的方法来说明人体脏腑组织之间复杂的生理、病理现象， 以揭示和把握各脏腑之间以及脏腑与环境之间的相互影响和相互制约的关系。如按脏腑的不同属性，功能和特点与五行类比；肝喜条达，有疏泄的功能，木有生发的特性，故以肝属“木”；心有温煦的作用，火有阳热的特性，故以心属“火”；脾为生化之源，土有生化万物的特性，故以脾属“土”；肺气主肃降，金有清肃、收敛的特性，故以肺属“金”；肾有藏精，主水的功能，水有润下的特性，故以肾属“水”。脏腑理论用这种类比的方法，不仅把五脏六腑归属于五行，同时还把脏腑之间的生理、病理方面的复杂现象用五行生克制化的关系来类比阐述，混元功法和中医的藏象理论用天人合一的整体观，运用“远取诸物，近取诸身”的原理，用“比类取象”的方法，把大自然的物质与人体脏腑相通应，如：八卦中“巽”威风《内经》把“风”善动的特性（疾风之象）类推到人体病机方面，把凡是活动性的、善变的、游走性、动摇性的病症（如眩晕、震颤、抽搐、行痹等）皆类比为属“风”，从而创立了“风气通于肝”的理论等等。病理学、生理学广泛的应用于两仪混元功法之中，同时也推动了气功学的发展，构成了混元疗法独有的特色。混元功法、疗法是把天象、地象、人象三结合为一体，并将阴阳五行贯穿其中，是人与天地相应的整体观的精华。
藏象学说的运用
藏象学说就是关于脏腑的学说，脏腑，即五脏六腑和奇恒之腑三类。五脏指心（包括心包络）、肝、脾、肺、肾；六腑指小肠、胆、胃、膀胱、大肠、三焦。脏与腑，主要是他们功能特点的不同而区分的。五脏是储藏精、气、神、血、津液的；六腑是主管食物、授、纳、消化、吸收、传导、排泄的；所谓“脏以藏为主，腑以通为用”。
六腑之外，还有奇恒之腑，即：脑、髓、骨、脉、胆、女子胞，因为它们既有异于正常的五脏，又不同于一般的六腑，所以称为“奇恒之腑”。它们在生理、病理方面与脏腑关系极为密切。